明永乐年间，朱棣即位，辛勤耕耘数年。平一谷（潘杰饰）与儿子张（孙耀伟饰）和浪子王九（李立群饰）游历京城，靠骗取平庸医术赚钱。王九低劣的医术夺走了他心爱的肉身，在捕头人的帮助下开了一家诊所。平日当他的大弟子，收日本武野幸福（罗志敏饰）为徒。王九和地主英啸（黄晓燕饰）相恋已久，但他死去的妻子邵瑶（张倩饰）的身影依然在他的心中。平时，他和农草堂（邓泉饰）都在太原医院考上了，都被录用了，但他还是怀念了城里的安逸。一位阿姨被段天明（王群饰）威胁，不敢认儿子草堂。原来，她平时就是当年被误抱的药神金农贵（王德顺饰）的儿子……
看过《皇朝太医》的网友对它的观后感：双女主的名字挺好的，灵枢，素问。
